外部ファイルといえば、CSSファイルとJavascriptファイルが思いつかれると思います。 通常のWebページはSEO対策として、HTMLファイルのヘッダー内にそのまま書き流すことはせず、外部ファイルとします。
管理者画面は、SEO対策は必要ありません（というより、クローラーに来られたら困ります）。
しかし、管理者画面には「極力シンプルなHTML」が基本です。別のページでも少し触れましたが、余計な記述は予期せぬエラーが起きる場合があります。余計な記述が多いと、システムエラーが発生した場合、プログラムが悪いのか？それともそれ以外が悪いのか？と原因を特定するのが遅くなります。
また、HTMLを修正する際、ヘッダーに記述が多すぎると余計なスクロールをさせなければいけないので、めんどいです。それに修正したいCSS箇所などは左右に画面を並べて修正する方が効率もよいです。いちいちヘッダーを見て、タグを見て・・・と繰り返すととても効率が悪いですね。
まずは、HTML内をシンプルにすることを目的に、CSSファイルとJavascriptファイルをHTMLファイルの外に設置しましょう。